Después de los eventos ocurridos en la primera parte, los cazafantasmas son enjuiciados por la destrucción de los tres últimos pisos del edificio ubicado en la calle Central Park West Nº55 y por otros daños a la ciudad. Como resultado, el juez ordena el cierre de la compañía y la prohibición de ejercer sus profesiones. Por su parte, Dana Barret trabaja como restauradora de pinturas en el Museo de Arte de Manhattan, en la restauración del autorretrato de Vigo el Cárpato.

Dana ahora tiene un hijo, en torno del cual han sucedido varios hechos inexplicables.

Después de una serie de sucesos relacionados con la pintura y el hijo de Dana, los cazafantasmas son autorizados para volver a ejercer sus funciones y terminar con la nueva amenaza que se cierne sobre la ciudad de Nueva York.

Tres parapsicólogos expulsados de la Columbia University en Nueva York, debido a sus estudios y prácticas poco ortodoxos, comienzan su propio negocio trabajando como cazafantasmas, e investigando fenómenos paranormales usando tecnología sofisticada para intentar capturar las manifestaciones ectoplasmáticas.

La aventura continúa en el punto donde dejamos «Piratas del Caribe: El cofre del hombre muerto» (segunda parte de la saga y predecesora de ésta) y de nuevo en esta entrega participan los tres protagonistas principales de la saga:

• Jack Sparrow interpretado por Johnny Depp.
• Elizabeth Swann interpretada por Keira Knightley.
• Will Turner interpretado por Orlando Bloom.

Volveremos a ver a Jack Davenport, Geoffrey Rush, en el papel del capitán Barbossa, aunque en esta ocasión ayudando a los personajes a quienes se enfrentó en la primera película Piratas del Caribe: La Maldición de la Perla Negra donde los acompañará en la búsqueda del capitán Jack Sparrow. Bill Nighy seguirá en el film interpretando al demonio marino Davy Jones, y se une al reparto como antagonista Chow Yun-Fat en el personaje del capitán Sao Feng.

Tras haber levantado la maldición del Perla Negra, una amenaza aún más aterradora se cierne sobre su capitán y su tripulación: Jack Sparrow tiene una deuda de sangre con el legendario militar había sido arruinada por el astuto capitán Sparrow), se ve obligada a huir tras la derrota, Elizabeth encadena a Jack al barco. Sparrow desaparece, mientras el kraken destruye el barco. Poco después, Norrington le entrega el corazón de Davy Jones a Beckett. El destino de los piratas así como su libertad, corren peligro: se acerca la batalla final.

Elizabeth tenía 12 años cuando navegaba junto a su padre, Weatherby Swann, y el Comodoro James Norringtonrumbo a Port Royal. Durante la travesía encontraron los restos de un barco atacado por piratas y a Will Turnertambién siendo un niño, flotando a la deriva con un extraño medallón dorado. Una vez el chico estuvo a salvo en su barco y temiendo que el medallón identificase al joven Will como un pirata, Elizabeth lo cogió y se lo quedó sin decir nada a nadie. Sólo ella pareció vislumbrar entre la niebla cómo un barco con velas negras abandonaba el lugar del desastre.

Años después se ve llegar a Jack Sparrow en una pequeña barca que mientras se acerca al muelle de Port Royal se va hundiendo. Al poner un pie en el muelle, inmediatamente le piden su nombre para poder entrar a Port Royal, pero Jack se libra de dar su nombre al sobornar al cobrador para después robarle el soborno (y unas cuantas monedas más).

Will Turner ya siendo un adulto trabaja como aprendiz de herrero en Port Royal desde entonces. Es evidente que siente algo por Elizabeth pero su baja clase social le impide tener el valor de acercarse a ella, la cual también parece mostrar interés por él.

Para la ceremonia de ascenso del Comodoro James Norringtton Elizabeth se pone el vestido que su padre le ha traído especialmente de Londres pues éste alberga la esperanza de que su hija y el Comodoro entablen una relación. Efectivamente al finalizar la ceremonia el Comodoro le propone a Elizabeth hablar a solas con la intención de proponerle matrimonio pero el encorsetado vestido le juega una mala pasada a Elizabeth y la falta de aire hace que se desmaye cayendo por un acantilado al mar. Al contacto con el agua el medallón dorado que llevaba al cuello, escondido a la vista de los demás, produce una llamada que atraerá más tarde a la tripulación del capitán Barbossa. El Comodoro ve horrorizado cómo su amada ha caído al mar pero la altura del acantilado y las rocas, que milagrosamente Elizabeth esquivó, le hacen desistir de su empeño de lanzarse a por ella desde ahí y corre al puerto junto con sus hombres.

Jack Sparrow, que está en el puerto de Port Royal tratando de hacerse con un barco, se lanza al rescate de Elizabeth tras verla caer. Jack se da cuenta que el vestido que lleva ella es demasiado pesado y resulta casi imposible mantenerla a flote por lo que se las ingenia para quitárselo y dejarla sólo con el canesú interior. Cuando consigue llevarla a tierra firme Elizabeth sigue sin conocimiento y todos temen por su vida pues no está respirando. En un alarde de ingenio Jack rasga el corsé que lleva permitiéndola respirar y escupir el agua tragada.

Aunque ha salvado la vida de Elizabeth, el Comodoro y su padre que ya han conseguido llegar donde está, no se conmueven y pretenden apresar a Jack por ser un conocido pirata. Elizabeth no está dispuesta a que apresen al hombre que ha salvado su vida y se interpone entre Jack y las armas que le apuntan. Jack, que tampoco está dispuesto a que le apresen, aprovecha la ocasión para tomar a Elizabeth como rehén y librarse así de la justicia. Esfuerzo en vano sin embargo porque finalmente es atrapado en la herrería donde trabaja Will Turner después de que estos dos entablen una lucha a espada.

Esa misma noche Port Royal es atacado por piratas y toda la ciudad está inmersa en el caos. Elizabeth es perseguida en su casa por dos piratas que dicen que ella tiene algo que les pertenece. Cuando la encuentran ella invoca el derecho de Parlamento (o Parley), sus perseguidores se acogen al código y la llevan ante su capitán, el capitán Barbossa. Creyendo que es mejor no revelar su condición de hija del gobernador Elizabeth se hace pasar por sirvienta y usa el apellido de Will, presentándose entonces ante el capitán como Elizabeth Turner. Ella pretende negociar el cese de las hostilidades contra Port Royal a cambio del medallón dorado que lleva al cuello y Barbossa parece estar de acuerdo con el trato. El único problema es que a Elizabeth se le olvidó mencionar en el trato que ella debía ser llevaba a puerto otra vez y el Capitán se la lleva en el barco.

Will Turner convence al Capitán Sparrow de que le ayude a encontrar a Elizabeth, que va a bordo del Perla Negra, a cambio de sacarle de la cárcel donde le han metido, trato que acepta rápidamente al saber que el apellido de Will es Turner. Ambos se hacen con un barco de la Armada Real llamado el HMS Interceptor y parten en busca de la chica. Mientras navegan Sparrow le hace saber a Will que es hijo de un pirata, William «Bootstrap Bill» Turner, Bill el Botas, pirata pero un buen hombre.

Ya en el barco, el Capitán Barbossa le explica a Elizabeth por qué tienen tanto empeño en conseguir el medallón dorado. Se trata de oro azteca maldito, todo aquel que robara las piezas doradas del cofre de piedra quedarían malditos eternamente, serían inmortales aunque no podrían sentir nada y se transformarían en esqueletos a la luz de la luna. Ahora trataban de encontrar todas las monedas del cofre que habían ido malgastando en mujeres y vino. Lo que no sabe ella es que es la sangre de «Bootstrap Bill» o la de sus hijos la que se necesita para acabar con la maldición...al decir que ella se apellidaba Turner los piratas la han tomado por hija de «Bootstrap Bill».

Jack y Will hacen una parada en la isla Tortuga para conseguir tripulación que les ayude a manejar el inmenso barco con el que se han hecho. Conversando con el marinero Gibbs, Will Turner se da cuenta de que el Perla Negra pertenecía a Jack Sparrow y que Barbossa, el segundo al mando, se amotinó y le dejó abandonado en una isla.

Jack y su tripulación se dirigen a Isla de la Muerte porque saben que es allí donde estará Barbossa, allí es donde guardan todo el oro azteca recuperado y donde tienen que acabar con la maldición mediante el pago de sangre. Will consigue rescatar a Elizabeth de la isla dejando allí a Jack inconsciente. La tripulación de Jack se acoge a la norma «hombre que queda atrás, se deja atrás» y se marchan sin él.

Con Jack como prisionero, Barbossa zarpa persiguiendo a Will y Elizabeth que se han llevado con ellos el medallón a bordo del Interceptor. El Perla Negra los alcanza y toda la tripulación del Interceptor es hecha prisionera por Barbossa y el barco destruido. Will, que ahora sabe que necesitan su sangre para acabar con la maldición, amenaza con pegarse un tiro y caer al mar si no liberan a Elizabeth y al resto de la tripulación. Barbossa acepta el trato pero Will olvida mencionar dónde y cómo liberará a la tripulación por lo que Elizabeth y Jack son abandonados en una isla, este lugar no es extraño para Jack puesto que fue ahí donde le abandonó por primera vez Barbossa cuando se amotinó.

Jack cuenta a Elizabeth que fue en esta isla donde pasó tres días bebiendo ron tras ser abandonado a su suerte hasta que un barco de contrabandistas de Ron le recogió. Antes, la leyenda contaba que Jack había escapado de la isla amarrando tortugas. Decide hacer una pequeña fiesta alrededor de una hoguera para que Jack se emborrache bebiendo ron. Cuando Jack se despierta de la resaca ve cómo Elizabeth ha usado todo el ron que quedaba en la isla (algo que nunca podrá perdonarle) para hacer una enorme hoguera y usar el humo como señal.

Gracias a esta señal acuden el Comodoro y su padre a su rescate, volviendo a hacer prisionero a Jack. Su padre no está dispuesto a ir a rescatar a Will pero Elizabeth convence al Comodoro de que vaya a por él como regalo de bodas. Ante la expectativa de casarse con Elizabeth el Comodoro acepta.

En Isla de la Muerte, Barbossa está a punto de sacrificar a Will para pagar la deuda de sangre. Sueltan a Jack para que colabore con el Comodoro y así tender a los piratas una emboscada. Jack va a la gruta donde está Barbossa e interrumpe el sacrificio diciendo que la Marina Real les aguarda fuera por lo que sería mejor acabar con la maldición cuando les hayan vencido. Jack aprovecha para «robar» una moneda del cofre sin que nadie se percate de ello.

Cuando la mayoría de piratas se ha ido Jack ataca a Barbossa, y cuando éste le clava su espada a Jack, éste, a la luz de la luna y convertido en un esqueleto le muestra la moneda tomada del cofre a Barbossa, quedando los dos en igualdad de condiciones. Will y Elizabeth también luchan contra los piratas que han quedado. Jack consigue devolver al cofre la última pieza y con la maldición acabada pega un tiro mortal a Barbossa.

El resto de piratas que había ido a atacar la Marina Real son apresados también al notar que la maldición ha terminado y ya no son inmortales.

Ya en Port Royal Jack es condenado a la horca por sus actos de piratería, pero Will, que no puede tolerar que ejecuten a un buen hombre, le intenta ayudar a escapar. Elizabeth ayuda a Will fingiendo un desmayo y desviando la atención del Comodoro. El intento de escape no funciona muy bien y ambos son acorralados por la guardia. Tras una conversación con el Comodoro, que se da cuenta de que Elizabeth no le ama a él, Will es dejado en libertad y Jack se despide diciendo «caballeros, lo siento, todos ustedes recordaran este día como el día en que casi atrapan al...» pero Jack no logra terminar su frase al tropezarse y caer al mar para ser recogido por su tripulación a bordo de el Perla Negra.

En el muelle, el Comodoro ordena un plazo de un día antes de reiniciar la búsqueda de Jack, como recompensa a sus recientes acciones. Después Will y Elizabeth se besan apasionadamente haciendo ver al padre de ésta a quién ha elegido su hija.

El país de Narnia ha sido invadido por los telmarinos. Sus antiguos habitantes, las criaturas mitológicas, han sido exterminados, si bien quedan algunos reductos escondidos en un bosque encantado.

Años después, el rey telmarino en funciones, Miraz, tío del heredero al trono Caspian, acaba de tener un descendiente. Nada más conocer la noticia el tutor del príncipe corre a advertirle que huya de una muerte segura a manos de su tío. Le provee de un caballo y un cuerno que debe hacer sonar sólo en caso de gran peligro. El peligro no se hace esperar y el príncipe Caspian, perseguido por los telmarinos hace sonar el cuerno.

En ese preciso momento, los hermanos Pevensie están en camino al internado en que estudian en Londres. El sonido del cuerno mágico provoca un fuerte viento, que invade la estación de metro, donde los niños esperaban, haciéndola desaparecer y llevando los hermanos al mundo de Narnia. Descubren entonces que en Narnia han pasado 1300 años desde que ellos se fueron, mientras en su mundo sólo ha pasado uno.

Posteriormente, rescatan a un enano, que iba a ser asesinado por dos guardias telmarinos. El enano se llama Trumpkin, y les sirve de guía para llegar hasta el príncipe Caspian. Por desgracia, el grupo se pierde, ya que al haber pasado más de un milenio, los hermanos no reconocen el país. Lucy dice ver al león Aslan, pero Peter y Susan no le creen y aunque Edmund sí cree lo que dice, no se enfrentan a los mayores. Sin embargo, consiguen encontrar al príncipe Caspian, que por entonces se ha unido a los narnianos para enfentarse a su tío Miraz.

El ejército narniano se refugia en el Altozano de Aslan, un montículo construido sobre la Mesa de Piedra. Deciden atacar al castillo de Miraz, desprotegido, ya que las tropas se han desplazado para atacar el Altozano. Pero por culpa de Caspian, el ataque resulta un fracaso total.

No les queda más remedio que enfrentarse a las tropas de Miraz en la plena situada frente al Altozano. Pero deciden ganar tiempo en un combate singular entre Peter y Miraz. Mientras tanto, Lucy y Susan parten en busca de Aslan. Miraz muere, asesinado por uno de sus lugartenientes, y los dos ejércitos se enfrentan en una batalla. Los narnianos están a punto de perder, pero Lucy encuentra a Aslan, que despierta a los árboles de Narnia, permitiéndose así que éstos acudan en ayuda al ejército narniano. Los narnianos vencen, y Caspian es coronado rey de Narnia.

Concluida su misión, los niños Pevensie han de volver a su mundo. Antes de hacerlo, se les revela que ni Susan ni Peter podrán volver a Narnia, ya que son demasiado mayores para ello. Pero los dos pequeños sí lo harán en un futuro.

Durante la segunda guerra mundial, los cuatro niños Pevensie: Peter, Susan, Edmund y Lucy, son enviados a la casa de un viejo profesor. Aburridos por las estrictas reglas impuestas por el ama de llaves, se dedican a explorar la casa. Un día, Lucy encuentra un gran armario (ropero) bellamente decorado, al que entra por curiosidad, apareciendo en una mágica tierra cubierta de nieve (Narnia). Allí conoce a un fauno, el Señor Tumnus que la invita a su casa y trata de adormecerla con una melodía de flauta, para llevársela a la malvada Bruja Blanca, reina de Narnia. En efecto, esta bruja a ordenado que le traigan cualquier ser humano que aparezca en Narnia. Pero el fauno se apiada de Lucy y la ayuda a volver a su mundo. Al salir del ropero ella intenta convencer a sus hermanos de su aventura pero nadie le cree. Una noche ella regresa a Narnia y su hermano Edmund la sigue. Lucy va a la casa del fauno, pero Edmund se pierde y se encuentra con la Bruja Blanca, que promete convertirlo en príncipe de Narnia si conduce a los otros niños hacia su castillo. Al salir los dos niños del armario, Peter y Susan preguntan a Edmund si ese mundo mundo mágico existe. Él lo niega y Lucy se pone muy triste. Pero, tiempo después, al huir del ama de llaves, los hermanos Pevensie entran todos juntos al armario.

La primera criatura con la que se encuentran es un castor parlante, el Señor Castor. Él los acompaña a su hogar, un dique. Junto a su esposa (la Señora Castor) les cuentan que el mundo en el que se encuentran es Narnia y que los guardias de la Bruja Blanca se han llevado al señor Tumnus por ayudar a Lucy. Los hermanos se enteran de que hay una profecía narniana que dice que dos hijos de Adán y dos hijas de Eva (seres humanos) llegarían a Narnia para derrotar a la Bruja Blanca y convertirse en los verdaderos Reyes y Reinas, y los castores piensan que los Pevensie son los destinados. También les comunican que Aslan, el gran León, está en Narnia y que deberían encontrarse con él. Mientras charlan, Edmund se escabulle para ir a reunirse con Jadis.

Peter, Susan, Lucy y los señores Castor emprenden el viaje para encontrarse con Aslan, y la Bruja Blanca, al enterarse, los sigue. Debido a la presencia de Aslan, el hechizo del invierno eterno empieza a romperse, lo cual entorpece la persecución de la bruja, que se desplaza en trineo.

Por fin llegan los niños al campamento de Aslan. Luego, un destacamiento parte para liberar a Edmund de la bruja. Al enterarse del hecho, esta se dirige al campamento de Aslan y le recuerda que, según los convenios establecido, todo traidor le tiene que ser entregado. Aslan decide discutir con ella en privado y acuerdan que él sería sacrificado para salvar a Edmund. Susan y Lucy lo acompañan esa noche noche a la Mesa de Piedra, donde la bruja lo asesina. Sin embargo, debido a la Gran Magia , Aslan no muere y las niñas lo descubren por la mañana. Mientras tanto, se libra una batalla entre los ejércitos de Peter y de la Bruja. Aslan y las niñas llegan con refuerzos: las criaturas que habían sido convertidos por la bruja en estatuas, y que Aslan ha devuelto a la vida. Derrotan a la Bruja Blanca.

Peter, Susan, Edmund y Lucy son coronados como Reyes y Reinas de Narnia, y Aslan se va. 15 años después, siendo los Pevensie ya adultos, salen de caza, y se encuentran con el farol en el que años atras Lucy y Tumnus se conocieron. Llegan entonces hasta el lugar por donde habián llegado a ese mundo. Regresan al suyo, volviendo a ser niños y descubriendo que no ha pasado ni un minuto en la Tierra desde que se fueron. A la noche siguiente Lucy regresa al ropero para volver a Narnia pero el Profesor Kirke, presente en la habitación, le dice a Lucy que ya no podrá volver a Narnia a través del ropero pero que tal vez Lucy y sus hermanos regresen a Narnia de otra manera, en el momento menos esperado.